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如何去除融解曲线的杂峰
2024-09-02  来源:上海炎熙生物科技有限公司

① 引物:如果引物设计不优,如引物设计软件得出的引物评分较低、引物扩增效率不满足90-110%,主要原因可能是引物本身质量不佳导致体系出现非特异性扩增。


解决方案:


重新设计引物,选择引物设计软件评分较高的2-3对引物进行合成,之后选择融解曲线无杂峰,扩增效率满足90-110%,且更接近100%的引物作为该基因的引物。


若该杂峰为引物二聚体引起,适当降低引物的投入量可以有效抑制引物二聚体的产生。


② 模板:cDNA模板存在基因组污染。


解决方案:


设计跨内含子引物进而避免基因组污染带来的干扰;或者选用带有基因组清除的逆转录试剂盒,逆转录前对RNA中混有的基因组进行清除。


③ CT值偏大:CT值≥30,可能是由于基因本身表达量低、或者扩增效率不满足90-110%而导致的基因CT值偏大。CT值较大的情况下,融解曲线容易出现杂峰。

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